Linear Time Construction of Indexable Elastic Founder Graphs

von Rizzo, Nicola
Veröffentlicht in IWOCA (33. : 2022 : Trier) Combinatorial algorithms (2022)

Combinatorial algorithms : 27th international workshop, IWOCA 2016, Helsinki, Finland, August 17-19, 2016 : proceedings

Veröffentlicht 2016

Chaining of Maximal Exact Matches in Graphs

von Rizzo, Nicola
Veröffentlicht in SPIRE (30. : 2023 : Pisa) String processing and information retrieval (2023)

Tailoring r-index for Document Listing Towards Metagenomics Applications

von Cobas, Dustin
Veröffentlicht in SPIRE (27. : 2020 : Orlando, Fla.; Online) String processing and information retrieval (2020)

Graphs Cannot Be Indexed in Polynomial Time for Sub-quadratic Time String Matching, Unless SETH Fails

von Equi, Massimo
Veröffentlicht in SOFSEM (47. : 2021 : Online) SOFSEM 2021: theory and practice of computer science (2021)

Special issue on combinatorial algorithms

Veröffentlicht 2018

Genome-scale algorithm design : biological sequence analysis in the era of high-throughput sequencing

von Mäkinen, Veli
Veröffentlicht 2015

Combinatorial algorithms : 27th international workshop, IWOCA 2016, Helsinki, Finland, August 17-19, 2016 ; proceedings

Veröffentlicht 2016

Scalable Reference Genome Assembly from Compressed Pan-Genome Index with Spark

von Maarala, Altti Ilari
Veröffentlicht in BigData (9. : 2020 : Online) Big Data - BigData 2020 (2020)